全自动微区取样仪，即在显微镜下观测，使用电动平台的精确移动来实现取样和收集样品过程，同时带真空吸附功能。根据具体使用要求选配不同类型的显微镜，体式、倒置、正置显微镜。它可以广泛应用于各个领域，并可根据具体的需求配置不同的配件，节省成本，突出使用性能。例如取岩石类样品可以使用带移动平台的体式显微镜，便于石笋样品的移动。以下是程序控制自动XYZ三维平移载物台，程序控制自动XYZ三向平移载物台图片。这种方式的取样仪采用垂直钻取样的方式,钻针能够稳定固在主机的上方,与真空收集部件在一个水平的位置。真空吸头可以斜视放置,与钻针在同一个位置,或者接近的位置，可在钻样的同时收集样品。

微钻取样器是专业对碳酸盐岩、锆石等岩石、矿物的微型取样设备。取样的大小决定使用钻头的大小，使用钻孔的大小和数量取决于需求分析。经常做碳酸盐研究的人知道,对稳定同位素C和O的分析，需要大约10微克样品可以满足高质量的同位素质谱分析使用，通过使用100微米直径钻头，钻入样本成分20微米，出现大约25至30个孔就可得到这个数量。使用方形板式样品，同样的100微米钻头，在600微米深孔中，将产生足够样品。对于小钻头，如直径8微米，钻入薄片20微米,得到的数量相对更大。当然这些说明是假定100%样品都是由吸管收集。其它的类型的样本分析，例如ICP，将有不同样品要求，孔的数量也将相应改变，根据具体需求来确认使用钻头大小，以及移动精度。